Am Anfang eines wissenschaftlichen Projektes steht bei uns meistens die Probennahme. Manchmal passiert dies unter erschwerten Bedingungen wie bei Sturm, Hitze oder starkem Seegang. In diesem Fall war es die Klebrigkeit des Schlicks.
Forschung
Probennahme im Wattenmeer
Tool-Entwicklung
Marine Pilzgesellschaften sind sehr divers und umfassen h?ufig Dikarya-Arten bis hin zu den basalen Pilzen. Gleichzeitig zeichnen sie sich durch einen hohen Prozentsatz an unbeschriebenen Arten aus. Um ?kologische Fragestellungen zu kl?ren, ist es essentiell, die umfassende Diversit?t einer Pilzgesellschaft zu erfassen und einzelne Arten benennen zu k?nnen. Nur so k?nnen Daten miteinander verglichen werden und ?kologische Hypothesen entwickelt und getestet werden.
Marine Pilze sind in den bestehenden Datens?tzen immer noch stark unterrepr?sentiert.
Wir haben ein Tool-Kit entwickelt, welches Unterstützung leistet, marine Pilze(gesellschaften) zu detektieren und zu klassifizieren. Dieses umfasst:
- verbesserte 18S rRNA Gensequenz-Datens?tze (in Zusammenarbeit mit dem SILVA-Team)
- 18S rRNA-Gensequenz Gensequenz Primerpaare für unterschiedliche Sequenzierungstechniken und geeignet für Gesellschaftsanalysen und gruppenspezifische Amplifizierung
- 18S rRNA Pilz-spezifischer phylogenetischer Referenzbaum & Alignment. Das Tool erlaubt eine taxonomische Klassifizierung von unbekannten Pilz-Taxa bzw. die Identifizierung und Klassifizierung von durch Umweltsequenzen gebildeten Clades (environmental clades)
- Analysepipeline für Illumina-generierte Sequenzen
- Entwicklung von einem CARD-FISH Protokoll zur Detektierung und Visualisierung von Pilzen in Wasserproben
Degradationskapazit?t mariner Pilze
Terrestrische Pilze besitzen h?ufig ein weites Spektrum an Exoenzymen, welche ihnen erlauben, labiles bis komplexes organisches Material zu zersetzen. Erste Pilotstudien an marinen Pilzen zeigen ?hnliche Muster. Allerdings ist bisher ungekl?rt, ob es Pilzgruppen-spezifische Substratpr?ferenzen gibt. Auch die beteiligten Enzyme und damit verbundene Zersetzungsmuster einzelner Polymerstrukturen sind bisher unbekannt. Diese Leitfragen werden von uns über ein interdisziplin?res Projekt bearbeitet.
Pilz-Pilz-Interaktionen
Mikroorganismen innerhalb desselben Habitats bilden h?ufig komplexe, netzwerkartige Interaktionsmuster. Die Interaktionen k?nnen von positiver Natur sein, indem 澳门皇冠_皇冠足球比分-劲爆体育ere Arten zusammenarbeiten, um z.B. komplexes Material zu zersetzen. Interaktionen k?nnen aber auch negativer Natur sein, indem sich die Interaktionspartner gegenseitig schw?chen oder verdr?ngen, z.B. durch einfaches ?berwachsen bishin zur Exkretion t?dlicher Metabolite. In unserem Projekt wollen wir herausfinden, ob es globale Muster in Pilz-Pilz-Interaktionen gibt und welche Metabolitgruppen in positven bzw. negativen Interaktionsmustern zum Einsatz kommen.